Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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Gm10378F6XQQ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Gm10378F6XQQ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Gm10378F6XQQ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Gm10378F6XQQ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm10378F6XQQ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
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Gm10378F6XQQ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Gm10378F6XQQ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Gm10378F6XQQ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Gm10378F6XQQ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Gm10378F6XQQ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Gm10378F6XQQ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Gm10378F6XQQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Gm10378F6XQQ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10378F6XQQ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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