Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Crocc2F6XLV1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Crocc2F6XLV1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Crocc2F6XLV1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Crocc2F6XLV1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Crocc2F6XLV1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Crocc2F6XLV1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Crocc2F6XLV1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Crocc2F6XLV1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Crocc2F6XLV1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Crocc2F6XLV1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Crocc2F6XLV1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Crocc2F6XLV1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Crocc2F6XLV1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms