Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms