Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngap1F6SEU4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms