Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms