Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col22a1E9Q7P1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms