Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Simc1E9Q6E9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Simc1E9Q6E9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms