Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srsf11E9Q6E5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srsf11E9Q6E5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srsf11E9Q6E5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srsf11E9Q6E5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srsf11E9Q6E5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srsf11E9Q6E5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srsf11E9Q6E5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srsf11E9Q6E5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Srsf11E9Q6E5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srsf11E9Q6E5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srsf11E9Q6E5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms