Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc85cE9Q6B2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms