Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtproE9Q612 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtproE9Q612 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms