Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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