Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ryr1E9PZQ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms