Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gm3002E9PW72 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3002E9PW72 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms