Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG8

9530053A07Rik, RIKEN cDNA 9530053A07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 2,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530053A07RikE9PVG8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9530053A07RikE9PVG8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9530053A07RikE9PVG8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms