Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms