Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
3425401B19RikD3Z1D3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms