Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmf1B9EKI3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
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