Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms