Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otud4B2RRE7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud4B2RRE7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms