Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trabd2bB1ATG9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms