Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Skint5A7XUY5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Skint5A7XUY5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms