Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms