Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms