Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd4A2AFR3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms