Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prdm16A2A935 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms