Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm2A2A7B5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms