Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp1bA1Z198 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp1bA1Z198 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms