Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71e1A1L3C1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms