Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd4Q9Z2D7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms