Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms