Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clip2Q9Z0H8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clip2Q9Z0H8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms