Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkraQ9WTX2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms