Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp18Q9WTV6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms