Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf346Q9R0B7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms