Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp21Q9QZL6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp21Q9QZL6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms