Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC3

Bhlha15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha15Q9QYC3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlha15Q9QYC3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha15Q9QYC3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms