Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms