Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms