Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3a1Q9QX15 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms