Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaja4Q9JMC3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaja4Q9JMC3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaja4Q9JMC3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnaja4Q9JMC3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnaja4Q9JMC3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnaja4Q9JMC3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnaja4Q9JMC3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnaja4Q9JMC3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms