Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd2apQ9JLQ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd2apQ9JLQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms