Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LitafQ9JLJ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms