Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtrQ9JKK8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms