Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms