Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ybx3Q9JKB3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ybx3Q9JKB3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms