Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FliiQ9JJ28 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FliiQ9JJ28 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms