Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2ird1Q9JI57 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2ird1Q9JI57 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2ird1Q9JI57 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2ird1Q9JI57 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2ird1Q9JI57 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2ird1Q9JI57 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms