Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl11Q9JHH5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms