Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Brd4Q9ESU6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms