Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms